رغم سنوات عمله القليلة بمجال الإخراج والتي لا تتعدى العشرة سنوات قدم من خلالهما 7 مسلسلات فقط إلا أن محمد سامي يعد من المخرجين الذين أثيروا الجدل خلال الفترة الماضية بسبب أزماته مع عدد من النجمات ودخوله في خلافات حادة معهم.
ويأتي في مقدمة هولاء النجمات غادة عبد الرازق والتي اتهمته بالتحرش خلال خلاف وقع بينهما بكواليس تصوير مسلسل حكاية حياة ولكن محمد سامي حرر محضر أخر ضدها واتهمها باستئجار بلطجية والإعتداء عليه وتدخلت نقابة المهن التمثيلية وأنهت الخلاف ولكن كل منهما مازال يرفض العمل مع الأخر.
الصدام الثاني كان بالفنانة ياسمين صبري والتي أعلنت ندمها عن المشاركة في بطولة مسلسل الأسطورة والذي تولى محمد سامي مهمة إخراجه موضحة أنه حذف مشاهدها من أجل مجاملة زوجته مي عمر وإعطائها مساحة أكبر بدورها مؤكدة أنها لن تعمل معه مرة أخرى .
ولكن محمد سامي قرر السخرية من ياسمين صبري مؤخرًا وقال بإحدى اللقاءات :" مبتعرفش تتكلم امام الكاميرا ومش موهوبة".
أما الصدام الثالث فكان مع نسرين أمين والتي وصفها بالممثلة درجة خامسة واتهمها بالغيرة من زوجته وأكد أنها إمتداد لعائشة الكيلاني .
