قرر رئيس قطاع المعاهد الأزهرية فضيلة الشيخ جعفر عبدالله تحويل 36 مدرسا بمعهد المرج الإعدادي الثانوي بنين للتحقيق وخصم يوم من راتبهم وكذلك خصم يومين من راتب أربعة موجهين لتقصيرهم في أداء عملهم.   كما قرر تحويل شيخ المعهد ين ومسئول الجدول للتحقيق لعدم اعتماد جداول المدرسين وختمها بخاتم المعهد . جاء ذلك في جولته الأحد 20 أكتوبر بالمعهد لتفقد الدراسة عقب إجازة عيد الأضحى والتي رافقه فيها مستشار اللغة الإنجليزية أحمد عبدالرحمن ، و مدير الشئون القانونية بمنطقة القاهرة الأزهرية محمد محمود  . ثم انتقل مباشرة بعد ذلك إلي معهد فتيات المرج والذي ظهر فيه سوء توزيع المدرسين وبمروره علي فصول المعهد وجد رئيس القطاع عبارات سياسية مسيئة ما بين مؤيد ومعارض لما يحدث في مصر..وعلى الفور أمر فضيلته بإعادة دهان الفصول التي بها العبارات. ومن جانبها عللت عميدة المعهد إلغاء طابور الصباح بدعوة بعض الطالبات من بنات المعهد ممن ينتمون مع أبائهم إلى جماعة الإخوان المسلمين إلي تظاهرات اليوم ضد ما يحدث في مصر وضد الانقلاب السياسية على حد قولها،.  فطالب الشيخ جعفر بناته من الطالبات بضرورة الفصل بين السياسية والعلم، فالسياسية لها مكانها والعلم له محرابه المقدس.